Hjortron växer på näringsfattig torv på mossar, framför allt tallmossar, i fattiga sumpskogar och fattigkärr samt i den torrare delen av vitmossmattan kring myrgölar. När tallskogen sluter sig finns arten kvar länge, men blomningen upphör. På öar i skärgården förekommer hjortron bland vitmossor i fuktsvackor i hällmarken. Här är det ofta endast en klon av antingen hon- eller hanplantor, som sprider sig med utlöpare och fruktsättningen uteblir alltså oftast.