Stensöta växer på mossbelupna block och stenar samt i klippskrevor i skogbevuxna berg och rasmarker, ibland även på marken i fuktig till frisk gran-, bland- eller lövskog, ofta i halvskugga. Mer exponerat ser man den i sprickor i hällmarker och på klipphällar i skärgården. Stensöta är den ormbunke som man träffar på längst ut i havsbandet, där den under vår och försommar lyser i ljusgröna mattor ganska högt upp på inte alltför exponerade klippsluttningar helst vända åt norr.