Träjon växer på frisk till torr mark i halvskugga men tål även beskuggning. Den förekommer i löv-, bland- och granskogar utefter bergrötter, i rasmark och bland block, men man finner den också i skogsbryn, hällmarker och igenväxande kulturmarker som vid stengärdesgårdar, rösen och dikeskanter i öppnare lägen. Träjon växer i stort sett torrare än de andra storvuxna ormbunkarna även om den ofta ses i blandbestånd.