Kustarun växer på frisk till fuktig mark i den lägre delen av lågvuxna havsstrandängar, ofta tillsammans med dvärgarun och smultronklöver, men även högre upp på torrare gräsmark tillsammans med trift och knutnarv. Man finner den också på betad gräsmark och gräsplättar i hällmark nära havet. Arten är betesgynnad men tycks trots detta inte ha minskat på senare tid, kanske beroende på att vegetationen på en del havstrandängar hålls nere av betande gäss.