Flädervänderot kan uppdelas i tre underarter, hårvänderot ssp. procurrens, äkta flädervänderot ssp. sambucifolia och strandvänderot ssp. salina. Endast den senare av dessa har ägnats uppmärksamhet under inventeringen, men den flädervänderot som växer på bohuslänska stränder stämmer inte med den östsvenska strandvänderoten. Här behandlas växten alltså utan hänsyn till underarter.
Flädervänderot växer i flera vitt skilda biotoper. Dels finner man den i halvskugga eller skugga i fuktig till blöt, näringsrik jord i skogsmark, både i ädellöv-, bland- och ren barrskog, oftast i skogskärr eller i raviner utefter bäckar och fuktdråg. Dels växer den exponerat på frisk till fuktig mark bland block och klippor på havsstränder och i klippstup. Dessutom förekommer den ofta i igenväxande fuktängar och annan frisk till fuktig, övergiven gräsmark tillsammans med älggräs och strätta.