Stenbräken växer i sprickor i bergväggar och hällar både exponerat och i halvskugga, ibland också i skuggade klippstup i ädellövskog. Arten undviker de mest svårvittrade bergarterna och förekommer gärna tillsammans med svartbräken på grönsten. Rasbranter, block och bergrötter i lövskog är andra vanliga ståndorter. Man kan även finna den i kulturpräglade miljöer som utmed stenmurar, rösen och stentrappor.