Myggblomster växer oftast bland vitmossa Sphagnum i kanten av höljor i blöta kärr, på gungflyn runt skogssjöar samt på öppna myrar. Ibland förekommer den i rätt täta bestånd av bladvass. Arten förekommer huvudsakligen på mossar och i fattig- och medelrikkärr, men kan även finnas i rikkärr.
Förändring - 13 %. – Myggblomster har minskat i likhet med många andra växter i samma miljö, sannolikt till följd av utdikningar samt igenväxning av myrmarker.