Gaffelbräken växer som täta tuvor i springor på hällar och bergbranter, speciellt där det är ljusöppet som på strandklippor, intill vägar, i betesmarker och på åkerholmar. Den förekommer framför allt på sura bergarter, eftersom det är denna typ av berggrund som dominerar, men även på kalkberg.

Förändring -12 %. – De tre arterna av småormbunkar, som växer på utpräglad hällmark: gaffelbräken, svartbräken och hällebräken har alla minskat, främst på grund av igenväxning som ökar beskuggningen av mindre hällmarker. Gaffelbräken dock i mindre utsträckning än de båda andra arterna.