Förekommer sällsynt i södra Sverige med nordgräns i Gästrikland; sällsynt i Uppland. Rödlistad. 39 kartblad, 48 kvadranter.
Stenfrö växer på stenig, grusig, ofta blockrik mark på eller i närheten av stränder. Den förekommer i bryn av lövskog och örtrik granskog, i små lövträdsdungar och strandsnår.
Förändring - 36 %. – Till skillnad från många andra av lundarnas och lövskogarnas arter har stenfrö minskat.