Säfferot har huvudsakligen sydöstlig utbredning i Sverige med endast ett fåtal förekomster norr om Uppland. Den finns även på Åland och sällsynt i Åboland. I Uppland som helhet är den mindre allmän, men vanligare i de östra och norra kustområdena. 241 kartblad, 394 kvadranter.
Säfferot är en karaktärsväxt för de s.k. stäppartade torrängarna, vilka man finner på kalkrik, torr mark, helst på öppna eller glest trädbevuxna, betade torrängar, gärna på gravfält och i torra hagmarker. Säfferoten finns även i andra torrängsliknande miljöer som på åkerholmar och vägkanter.
Förändring - 22 %. – Eftersom torrängar med säfferot är alltför torra för att bete skall vara lönande, har det upphört på många av dem, vilket leder till att de växer igen, till en början med buskar som slån och en. I vissa fall skogsplanteras de med i första hand tall. I båda fallen leder det till att torrängsfloran successivt försvinner. Även om säfferot klarar igenväxningen längre än de mest känsliga torrbacksväxterna, har den minskat totalt sett.