Allmän i Uppland, men med få förekomster i skärgården. 622 kartblad, 1800 kvadranter.
Almq. I skogstrakter allmän; i slättbygder och skärgården tämligen allmän (på de yttre skären dock sällsynt).
Flaskstarr kan förekomma i de flesta typer av våtmarker, där den stundom bildar utbredda bestånd eller är dominerande bland andra starrarter, t.ex. på strandmader och i starrkärr. Den växer på sjö- och åstränder, i dammar, diken och andra mindre vattensamlingar, i kärr från fattigkärr till extremrikkärr och i hällkar.