Korallrot finner man i kärrkanter, myrlaggar, sumpskogar, både i lövsumpskog (ofta alsumpskog) och gransumpskog samt i fuktiga lundar, i skärgården även i täta videsnår. Den uppträder också i glesa vassbälten, där den dock kan vara svår att upptäcka. Ibland växer den på kulturskapade ståndorter som vägrenar och fuktiga grusgropar. Vanligtvis fåtalig, men bestånd med flera tiotals exemplar kan påträffas.