Gäddnate förekommer i både näringsrika och näringsfattiga sötvatten på dy, gyttja eller lera. Den kan växa i såväl skyddade vikar av stora sjöar som i småvatten och även förekomma i permanenta vattensamlingar i kärr. Den saknas i brackvatten, men växer i hällkar och små myrgölar långt ut i skärgården.