Nästrot växer huvudsakligen i kalkpåverkad frisk–kärrartad skogsmark, vanligen i granskog eller blandskog. Ängsgranskogar med sumpskogspartier samt skogbevuxna kärrkanter är typiska biotoper. I kusttrakterna och Mälarområdet finns den ibland i fuktiga lövskogar och lundar. En mer avvikande växtplats är Ekolsunds slottspark, där den växer under glesa lövträd på rätt torr mark i en äldre park.

Förändring + 31 %. – Nästrot har ökat kraftigt. Ökningen har framför allt skett i den nordöstra delen av landskapet och i Mälarområdet, medan den i de centrala delarna och de södra kusttrakterna är ungefär lika vanlig som tidigare. Ökningen är svårförklarlig, ett minskat skogsbete kan möjligen ha gynnat arten.