Smalkaveldun förekommer i näringsrika till medelrika sjöar, samt grunda brackvattenvikar och -sund.

Ganska vanlig; funnen i 72 rutor (41%); tidigare flerstädes (Holmgren 1942). Smalkaveldun är utbredd i kusttrakterna, men har endast spridda förekomster i norr, och är sällsynt i nordväst. Arten har ökat både i inlandet och den sydöstra skärgården, sannolikt p.g.a. övergödning och upphört bete på sjöstränder.