Toppfrossört växer på havsstränder och fuktig, stenig, kustnära mark. Den förekommer i fuktängsvegetationen innanför havsstränderna, samt i snår.

Ganska vanlig i havsstrandrutor; funnen i 27 rutor (15%); tidigare flerstädes på havsstränder (Holmgren 1942). Toppfrossört är utbredd längs sydkusten mellan Torhamn och Karlshamn, samt har västliga förekomster på Hanö i Mjällby och Utkörningen i Sölvesborg.