Sjöfräken växer bl.a. vid sjöstränder, å-mader, lugna å-fåror, fattigkärr och diken. Den är ofta beståndsbildande vid näringsfattiga sjöstränder och i kärr.

Mycket vanlig; funnen i 153 rutor (87%); tidigare allmän (Holmgren 1942). Sjöfräken är utbredd i hela landskapet, utom i de yttersta kustområdena.