Gropnate förekommer i näringsfattiga till medelrika sjöar, dammar och lövskogskärr, samt även vattenfyllda stenbrott.

Mindre vanlig; funnen i 29 rutor (16%); tidigare flerstädes (Holmgren 1942). Gropnate är glest spridd i större delen av Blekinge. Arten har inga gamla lokaler i de norra delarna av landskapet, vilket eventuellt kan bero på ett förbiseende.