Bäcknate förekommer i diken, skogskärr och bäckar.

Vanlig; funnen i 117 rutor (66%); tidigare tämligen allmän (Holmgren 1942). Bäcknate är utbredd i inlandet, men går även ut till kusten och i skärgården i de mellersta och östra delarna av landskapet. Arten uppgavs som ”här och där” av Svanlund (1889b) och har möjligen ökat under 1900-talet.